Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGNBP2Q9H3C7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms