Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL3Q9H2J4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL3Q9H2J4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms