Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC90BQ9GZT6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms