Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms