Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms