Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD1Q9BXT4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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