Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPOQ9BU64 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms