Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms