Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms