Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms