Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2E2Q96LR5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms