Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CMTM5Q96DZ9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms