Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EAF2Q96CJ1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms