Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMARCE1Q969G3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms