Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6Q969F1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms