Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms