Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC12Q8WUD4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC12Q8WUD4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms