Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3RF3Q8TEJ3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms