Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BEST4Q8NFU0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms