Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00116Q8NCU8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00116Q8NCU8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms