Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DTX3Q8N9I9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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