Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMTC2Q8N394 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMTC2Q8N394 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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