Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTROBQ8N137 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTROBQ8N137 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTROBQ8N137 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTROBQ8N137 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTROBQ8N137 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTROBQ8N137 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTROBQ8N137 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms