Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPAP2Q8IXW5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms