Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R42Q7Z4L9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms