Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIAT1Q6ZQX7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms