Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSTM1Q6UX27 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms