Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL17Q6TDP4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms