Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S2Q6QNY1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BLOC1S2Q6QNY1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms