Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NANOGP8Q6NSW7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms