Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CLQ60I27 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms