Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms