Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms