Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms