Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VWC2Q2TAL6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWC2Q2TAL6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms