Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TYSND1Q2T9J0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms