Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPROQ16827 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPROQ16827 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPROQ16827 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPROQ16827 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPROQ16827 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPROQ16827 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPROQ16827 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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PTPROQ16827 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPROQ16827 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPROQ16827 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPROQ16827 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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