Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms