Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FXNQ16595 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms