Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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