Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF11Q15544 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms