Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPD2Q15021 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPD2Q15021 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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