Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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