Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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HERPUD1Q15011 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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HERPUD1Q15011 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD1Q15011 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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