Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCAPHQ15003 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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