Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ODF1Q14990 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms