Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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RAB39AQ14964 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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RAB39AQ14964 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RAB39AQ14964 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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RAB39AQ14964 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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RAB39AQ14964 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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RAB39AQ14964 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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RAB39AQ14964 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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RAB39AQ14964 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB39AQ14964 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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