Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP1BQ14684 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP1BQ14684 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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