Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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