Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BECN1Q14457 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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